BioBlender adalah pakej perisian yang dibina di atas perisian pemodelan 3D sumber terbuka.Biologi berfungsi di nanoscale, dengan objek yang tidak kelihatan pada mata manusia.Dengan BioBlender adalah mungkin untuk menunjukkan beberapa aksara yang mengisi sel-sel kita, berdasarkan data saintifik dan standard tertinggi manipulasi 3D.Para saintis di seluruh dunia mengkaji protein di peringkat atom dan maklumat deposit di repositori awam Protein Data Bank, di mana setiap molekul digambarkan sebagai senarai atom dan koordinat 3D mereka .... Dengan pengguna BioBlender boleh mengendalikan protein dalam ruang 3D, memaparkan permukaannya dalam cara photorealistic, dan pergerakan protein yang rumit berdasarkan pengakuan yang diketahui.Fail PDB boleh dimuatkan dari direktori yang ditetapkan pengguna atau dimuat turun terus dari tapak PDB (dengan memasukkan kod PDB).Protein ini dipaparkan dalam 3D (sebagai atom atau permukaan molekul) dan pengguna dapat mengira dan menggambarkan sifat permukaannya, Keupayaan Lipofilik Molekul dan Potensi Elektrostatik.Untuk gerakan protein, BioBlender mengira perantaraan di antara dua konformasi menggunakan Blender Game Engine.Program ini memberikan sebagai output kedua-dua fail PDB pertengahan dan gambar yang diberikan sebagai filem.BioBlender adalah pelaksanaan Blender, sumber terbuka, diedarkan bebas, berbilang platform, program interoperable dan disokong animasi 3D, kesan visual dan permainan video.Gabungan grafik komputer 3D, enjin permainan dan program saintifik, menjadikan BioBlender alat lengkap untuk menghuraikan pergerakan protein dan memaparkan ciri-ciri permukaan mereka menggunakan kod visual berdasarkan tekstur dan kesan khas zarah.Dengan cara ini adalah mungkin untuk menunjukkan sifat fizikal dan kimia molekul dalam gerakan.BioBlender adalah hasil daripada kolaborasi, didorong oleh kumpulan SciVis di CNR di Pisa (Itali), antara saintis pelbagai bidang (biologi, kimia, fizik, sains komputer).