Cytoscape adalah platform perisian sumber terbuka untuk menggambarkan rangkaian kompleks dan mengintegrasikannya dengan sebarang jenis data atribut.Banyak plugin tersedia untuk pelbagai jenis domain masalah, termasuk bioinformatika, analisis rangkaian sosial, dan web semantik.Cytoscape menyokong banyak kes penggunaan dalam biologi molekul dan sistem, genomik, dan proteomik: Muatkan data interaksi molekul dan genetik dalam banyak format Projek dan mengintegrasikan dataset global dan anotasi fungsi Menetapkan pemetaan visual yang kuat di seluruh data ini Lakukan analisis maju dan pemodelan menggunakan plugin Cytoscape Visualizedan menganalisis data jalur laluan manusia seperti Reactome atau KEGG.